Perpustakaan
DESKRIPSI DATA LENGKAP
JudulDOCKING MOLEKULER SENYAWA BIOAKTIF UMBI ANGGREK TANAH (Geodorum Densiflorum (LAM) SCHLTR.) TERHADAP PROTEIN TARGET KANKER PAYUDARA
Nama: SYILVANA VINDAH MOKALE
Tahun: 2026
Abstrak
Kanker payudara merupakan tantangan kesehatan global dengan prevalensi yang terus meningkat. Terapi konvensional seringkali menimbulkan efek samping berat dan resistensi, mendorong eksplorasi senyawa bioaktif alami sebagai kandidat antikanker alternatif. Penelitian ini bertujuan menganalisis profil fisikokimia dan afinitas ikatan senyawa bioaktif dari umbi Geodorum densiflorum terhadap protein target kanker payudara (ER?, PR, PDK1, Bcl-xL, dan m-TOR) melalui metode molecular docking. Sebanyak 19 senyawa bioaktif hasil identifikasi LC-MS dievaluasi menggunakan Lipinski Rule of Five melalui SwissADME, kemudian dilakukan docking menggunakan AutoDock Vina 1.5.7. Validasi metode menunjukkan nilai RMSD ?2,0 Å untuk semua protein target, mengonfirmasi reliabilitas metode. Hasil analisis fisikokimia menunjukkan 7 senyawa (36,8%) memenuhi kriteria Lipinski Rule of Five. Hasil molecular docking mengidentifikasi beberapa senyawa dengan afinitas ikatan terbaik senyawa 2-(1,3-benzothiazol-2- yl)-3-(4-oxobenzo[h]chromen-3-yl)prop-2-enenitrile menunjukkan aktivitas multitarget terhadap PDK1 (-8,2 kkal/mol), ER? (-9,8 kkal/mol), PR (-8,8 kkal/mol), dan m-TOR (-9,0 kkal/mol); senyawa methyl 5-[(3R,4aS,7R,8R,8aS)-3,4'-dihydroxy- 4,4,7,8a-tetramethyl-6'-oxospiro [2,3,4a,5,6,7-hexahydro-1H-naphthalene-8,2'- 3,8-dihydrofuro[2,3-e]isoindole]-7'-yl]pentanoate terhadap PDK1 (-8,9 kkal/mol); dan senyawa N-(3-aminophenyl)-4-[[4-[4-[[3- [(3-aminophenyl)carbamoyl] -2- hydroxynaphthalen-1-yl]diazenyl] anilino]phenyl] diazenyl] -3- hydroxynaphthalene-2-carboxamide terhadap m-TOR (-10,3 kkal/mol), menunjukkan afinitas lebih tinggi dibanding ligan native. Analisis interaksi molekuler menunjukkan pembentukan ikatan hidrogen dengan residu asam amino kunci pada situs aktif protein target. Penelitian ini memberikan bukti in silico bahwa senyawa bioaktif umbi G. densiflorum memiliki potensi sebagai kandidat inhibitor multi-target untuk kanker payudara dan perlu divalidasi lebih lanjut melalui studi in vitro dan in vivo. Kata kunci: docking molekuler, Geodorum densiflorum, kanker payudara, protein target, senyawa bioaktif

Sign In to Perpus

Don't have an account? Sign Up