ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
| JudulSIMULASI DOCKING MOLEKULER SENYAWA FLAVONOID DARI TANAMAN GENUS KAEMPFERIA TERHADAP ENZIM PROTEASE HUMAN IMUNODEFICIENCY VIRUS-1 |
| Nama: Siti Wulansari |
| Tahun: 2019 |
| Abstrak ABSTRAK Kaempferia merupakan genus dari tumbuhan yang diketahui memiliki potensi sebagai anti HIV. Penelitian ini bertujuan untuk memprediksi aktivitas dan model interaksi senyawa dari genus Kaempferia yang berpotensi sebagai inhibitor Enzim Protease Human Immunodeficiency Virus-1 melalui metode docking molecular. Simulasi docking molekuler dilakukan dengan software Autodock Vina menggunakan komputer Windows 7 Pro Operating System dengan spesifikasi RAM 4 GB, Intel (R) Core™ i3-2364M CPU @1.40GHz 1.40GHz. Validasi berdasarkan nilai Root Mean Square Deviation (RMSD) dengan metode cross docking. 30 data struktur senyawa kimia tumbuhan genus Kaempferia diambil dari website KnapSack sebanyak 16 senyawa dan literatur jurnal penelitian sebanyak 14 senyawa. Model enzim protease diunduh dari situs Protein Data Bank dengan kode 1T3R. Hasil penelitian diperoleh nilai RMSD yang memenuhi syarat yaitu 1,344 Å (< 2 Å). Terdapat 6 senyawa yang berpotensi sebagai penghambat aktivitas Protease HIV-1 dari genus Kaempferia yaitu Boesenbergin B (-9.6 kkal/mol) Hesperidin (-9.1 kkal/mol), kaempferide (-8.7 kkal/mol), Quercetin (-8.6 kkal/mol) Kaempferol, (-8.5 kkal/mol), dan Naringin (-8.0 kkal/mol) dilihat dari kemampuannya berinteraksi dengan sisi aktif enzim protease yaitu ASP 25A dan ASP 25B. Kata kunci : Kaempferia, Flavonoid, Molecular Docking, Protease HIV-1. |