| JudulAplikasi DNA Barcoding Untuk Identifikasi Caridina Sulawesi Cai & Ng, 2009 Dari Danau Kalimpa'a, Poso, Sulawesi Tengah |
| Nama: SYAFINA QURATU ‘AINI |
| Tahun: 2026 |
| Abstrak Caridina sulawesi merupakan spesies udang air tawar endemik Sulawesi yang menunjukkan variasi morfologi antar populasi, khususnya antara populasi dari Danau Kalimpa?a, Sulawesi Tengah, dan populasi dari wilayah lain. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi spesimen Caridina dari Danau Kalimpa?a serta menganalisis variasi genetiknya menggunakan pendekatan DNA barcoding dengan gen mitokondria cytochrome c oxidase subunit I (COI). Sebanyak enam sampel dianalisis dan menghasilkan sequence sepanjang 792 bp dengan tingkat kemiripan 99–100% terhadap sequence referensi C. sulawesi dari Napu, Sulawesi Tengah, berdasarkan analisis BLAST. Analisis jarak genetik menunjukkan tidak adanya perbedaan genetik antara populasi Danau Kalimpa?a dan Napu (0%), serta perbedaan kecil dengan populasi Maros, Sulawesi Selatan (0,7%). Konstruksi pohon filogenetik menggunakan metode Maximum Likelihood menunjukkan bahwa seluruh populasi C. sulawesi membentuk satu klade monofiletik. Hasil ini mengonfirmasi bahwa populasi Caridina dari Danau Kalimpa?a merupakan spesies C. sulawesi dengan variasi genetik tingkat populasi yang kemungkinan dipengaruhi oleh isolasi geografis. |