ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
| JudulAnalisis Keragaman Genetik Berbasis Marka RAPD Pada Tanaman Kopi (Coffea Spp.) Asal Desa Dombu, Rano Dan Bangkir |
| Nama: NURFADILAH |
| Tahun: 2024 |
| Abstrak Marka RAPD dapat digunakan untuk mendeteksi keragaman genetik dari berbagai spesies kopi. Pada penelitian ini, 10 primer RAPD digunakan untuk menganalisis keragaman genetik dari 6 genotipe kopi lokal dari desa Dombu, Rano dan Bangkir. Profil pita DNA diterjemahkan ke dalam data biner dengan ketentuan nilai 0 untuk tidak ada pita dan 1 untuk adanya pita DNA. Data hasil scoring digunakan untuk menghitung tingkat polimorfisme serta hubungan kekerabatan menggunakan koefisien kesamaan Jaccard dan metode kluster UPGMA. Jumlah pita yang dihasilkan adalah 75 pita, dengan persentase polimorfisme sebesar 100%. Ditemukan bahwa DNA kopi Tipika dan Liberika yang berasal dari Desa Dombu, Robusta dan Dara dari Desa Rano, Lokal Bangkir dari Desa Bangkir dapat diamplifikasi dengan primer OPA-01, OPA-02, OPA-07, OPA-16, OPD-08, OPG-03, OPI-07, OPY-10 dan OPX-20. Tetapi tidak dapat digunakan untuk amplifikasi genotipe kopi Robusta Dombu. Analisis kluster mengelompokkan genotipe tersebut ke dalam 3 kluster utama berdasarkan desa asalnya. Robusta Rano dan Dara Rano memiliki koefisien kesamaan terbesar yaitu 57%. Penelitian ini menunjukkan bahwa genotipe kopi lokal Desa Dombu, Rano dan Bangkir memiliki genetik yang beragam. |