JudulANALISIS IN-SILICO PROTEIN DRD4 DAN DEAF1 YANG DIEKSPRESIKAN OLEH GEN DRD4 DAN DEAF1 PENYEBAB PERILAKU MEMATUK BULU PADA AYAM (Gallus Gallus) DAN PEMANFAATANNYA SEBAGAI SUMBER BELAJAR |
Nama: NI KADEK DEWI PERMATASARI |
Tahun: 2022 |
Abstrak Ni Kadek Dewi Permatasari, 2021. “Analisis In-silico Protein DRD4 dan DEAF1 yang Diekspresikan oleh Gen DRD4 dan DEAF1 Penyebab Perilaku Mematuk Bulu pada Ayam (Gallus gallus) dan Pemanfaatannya Sebagai Sumber Belajar”. Skripsi. Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Tadulako. Pembimbing (1) I Made Budiarsa, (2) I Nengah Kundera. Protein DRD4 dan DEAF1 berperan penting terkait dengan perilaku mematuk bulu pada ayam, protein ini diekspresikan oleh gen DRD4 dan DEAF1. Tujuan penelitian ini memprediksi struktur tiga dimensi protein DRD4 dan DEAF1 pada ayam. Sekuen protein target diperoleh dari server UniProt dengan kode akses masing-masing adalah DRD4 (B6UVA0) dan DEAF1 (B6UV99). Prediksi struktur tiga dimensi menggunakan server SWISS-MODEL, analisis komposisi asam amino menggunakan program BioEdit serta visualisasi model menggunakan program Chimera 1.15. Hasil penelitian menunjukkan bahwa Protein DRD4 memiliki nilai identity 60,49%, nilai GMQE 0,58, tersusun atas 378 asam amino dengan berat molekul sebesar 41902,06 Daltons. Protein DRD4 memiliki struktur Alpha-helix serta ligan OLA (oleic acid) dengan residu hidropobik berupa (Cys, Leu, Val, Thr, Ala, Lys, Tyr, Phe, Ile, Gly, Trp, Met, dan His), residu karboksil berupa (Glu, Asp, dan Val) dan residu amina berupa (Cys dan Lys). Protein DEAF1 memiliki nilai identitiy 93,18 %, GMQE 0,02, tersusun atas 546 asam amino dengan berat molekul sebesar 58355,43 Daltons. Protein DEAF1 memiliki struktur Alpha-helix dan 2 ligan ZN (Zink Ion) dengan residu hidropobik berupa (Cys, Val, Gly, Ala, Met, Thr, His, Lys, Tyr, Phe, Trp, dan Ile), residu karboksil berupa (Glu, dan Asp) dan residu amina berupa (Ser dan Lys). Hasil uji kelayakan modul praktikum dari penelitian ini sangat layak dijadikan sumber belajar pada mata kuliah genetika dengan persentase sebesar 89 %. Kata kunci: Ayam (Gallus gallus), Protein DRD4, Protein DEAF1, In-silico |