JudulPREDIKSI STRUKTUR TIGA DIMENSI PROTEIN BETA-NGF PADA BURUNG MERPATI (Columba Livia) DAN PEMANFAATANYA SEBAGAI SUMBER BELAJAR |
Nama: NUR ALAM |
Tahun: 2020 |
Abstrak Nur Alam, 2019. Prediksi Struktur Tiga Dimensi Protein ?-NGF pada Burung Merpati (Columba livia) dan Pemanfaatannya sebagai Sumber Belajar. Skripsi, Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Tadulako. Pembimbing I Made Budiarsa. Protein ?-NGF berperan dalam kelangsungan hidup sel neuron dan diferensiasi embrio aves yang diekspresikan oleh gen NGF. Informasi protein ?-NGF telah diidentifikasi pada ayam dan masih terbatas dilaporkan pada burung Merpati. Tujuan penelitian adalah memprediksi struktur tiga dimensi untuk menambah informasi dalam karakteristik protein ?-NGF burung Merpati. Protein diperoleh dari server UniProt dengan kode akses B4ZE95 dengan template 1.www.1.B. yang diprediksi menggunakan server Swiss-Model dengan pendekatan homologi dan visualisasi protein pada program Chimera. Hasil analisis menunjukkan bahwa protein ?-NGF burung Merpati dan template memiliki nilai identity sebesar 89.91%, QMEAN 0.51 serta GMQE 0.44. Struktur tiga dimensi protein memiliki asam amino hidrofobik Ile, Leu, Trp, Lys, Phe, Val, Ala, Thr, His, Gly, Met, Cys; karboksil Glu, Ser, Asp; amina Lys, Thr dengan 83 ikatan hidrogen. Implementasi kajian ini yang disusun dalam bentuk modul layak digunakan sebagai sumber belajar dengan persentase sebesar 88%. Kata kunci: ?-NGF, Struktur Protein, Swiss-Model, Chimera |