ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
ESTD PERPUSTAKAAN UNTAD
| JudulStruktur Tiga Dimensi Protein NT-3 (Neurotrophin 3) Pada Burung Merpati (Columba Livia) Menggunakan Program Swiss-Model Dan Pemanfaatanya Sebagai Sumber Belajar |
| Nama: TINA ZARKIYANI |
| Tahun: 2020 |
| Abstrak Tina Zarkiyani, 2020. Struktur Tiga Dimensi Protein NT-3 (Neurotrophin-3) pada Burung Merpati (Columba livia) menggunakan Program SWISS MODEL dan Pemanfaatanya Sebagai Sumber Belajar. Skripsi. Program Studi Pendidikan Biologi, Jurusan Pendidikan Matematika dan Ilmu Pengetahuan Alam, Fakultas Keguruan dan Ilmu Pendidikan, Universitas Tadulako. Pembimbing I Made Budiarsa. Protein NT-3 berperan penting dalam perkembangan dan diferensiasi neuron, serta memiliki keunikan yang cukup menarik pada anggota keluarga neorotrophin, yaitu dapat berikatan dengan 3 reseptor Trk yaitu TrkC, TrkA dan TrkB. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui struktur tiga dimensi protein NT-3 pada Columba livia. Protein target diperoleh dari server Uniprot dengan kode akses PKK30025.1 menggunakan template 3buk.1A (PDB-ID) dianalisis secara in-silico melalui metode homologi menggunakan server SWISS-MODEL. Hasil penelitian menunjukkan bahwa struktur tiga dimensi protein NT-3 target dengan template membentuk struktur ?-sheet dan loop, yang tersusun dari 304 asam amino dengan komposisi asam amino tertinggi adalah serin sebesar 8,88 mol dan asam amino terendah triptofan 1,32 mol. Hasil analisis kualitas struktur diperoleh nilai identity 98,20 %, QMEAN sebesar 0,8, QMQE 0,25, dan analisis pada Plot Ramachandran diperoleh nilai outliers sebesar 0,92 ?n nilai most favoured region sebesar 94,5 %, dengan kualitas struktur yang baik. Hasil penelitian dijadikan informasi sumber belajar dalam bentuk modul dengan presentasi kelayakan sebesar 81,69 %. Kata Kunci : Protein NT-3, Struktur Tiga Dimensi, Homologi, SWISS-MODEL In-silico. |